在制定巴巴罗萨计划期间，布劳希奇没有提出任何有效意见。当有人提出德军将陷入两线作战的困境时，他表示自己无能为力。1941年5月，在入侵苏联前夕，希特勒下达了“政治委员”命令，要求德军在俘虏苏军政委后要立即枪毙。一些军官要求布劳希奇带头抵制这项命令，但布劳希奇拒绝了，他不想冒风险。
曼施坦因曾这样评价当时的布劳希奇：“我确信他在精神上已经厌倦了同这样一个有着残忍意志的人进行斗争。他压制了自己的愤怒和烦恼，因为他在辩论方面根本不是希特勒的对手。”
苏德战争爆发后的第4天，希特勒就越过陆军总司令开始向各集团军群直接下达命令。后者唯一一次坚持己见的是他反对8月初希特勒下达的“南北分兵”的命令，他同哈尔德、博克、霍特和古德里安都主张继续向莫斯科进攻，但希特勒坚持把装甲部队调往列宁格勒和基辅。
9月16日，德军攻占基辅，俘虏苏军60多万人。此时希特勒有意让部队转入防御，等到冬季过去后再发起新一轮的进攻。布劳希奇和博克建议继续向莫斯科进攻，他们认为按照过去的推进速度，德军完全可以在冬季到来前拿下莫斯科。
希特勒被将领们的信心所鼓舞，他进一步提出了更高的要求，命令部队在冬季到来前将战线推进到伏尔加河中游，这意味着德军要攻占莫斯科、列宁格勒、罗斯托夫等苏联大城市。这显然是不切实际的目标。
的“黄色方案”提交给希特勒。这份计划严重缺乏想象力，几乎就是抄袭一战前的“施里芬计划”。德军依旧将主力置于战场右翼，先在低地三国境内击败联军，然后进入法国境内。同时中路实施辅助进攻；左翼则在马其诺防线当面完全采取守势。
让希特勒不满意的还有布劳希奇建议他不要在冬季发动进攻，他的理由是部队需要时间囤积弹药，此外冬季昼短夜长而且雾气很大，这将降低空军对地面的支援强度。
希特勒先是否决了推迟进攻的建议，他确定将在1939年11月的第三周实施黄色方案。对于方案本身，他于10月25日召开的军事会议上提出了自己的看法，希望将进攻的主要方向向南偏移，在马斯河以南发动进攻。这个建议让布劳希奇和哈尔德大吃一惊，随即指出了它的缺陷。双方为此持续争论了很长时间，最终没有形成统一意见。但在这次会议上，希特勒重申了进攻时间不得推迟，并明确具体的时间是1939年11月12日。
11月5日，布劳希奇和希特勒再次会面。为了强调自己的观点，布劳希奇除了重申进攻地点和时间存在的困难之外，他还愚蠢地指出德国步兵师在波兰战役期间缺乏进攻精神，还发生了纪律松懈，甚至是“兵变”的现象。他在最后提醒希特勒，希望他能比较一下1939年德国陆军和1918年帝国陆军的状态有什么共性，而一战的德军正是在那一年崩溃的。
希特勒被激怒了，他意识到陆军总司令在撒谎。暴怒之下他质问布劳希奇，他提到的兵变具体指的是哪些部队。布劳希奇被问得哑口无言，希特勒则向他吼道：“没有前线指挥官向我汇报部队缺乏进攻精神！”随后他夺过布劳希奇手上拿的笔记本，将它扔进了自己的保险箱，他还警告对方自己将立即飞往前线视察，看看到底存不存在布劳希奇所说的问题。
11月10日，长期忍受屈辱和恐惧的布劳希奇第一次心脏病发作。他在医院里被告知病情非常严重，已经无法治愈。尽管如此他还是在几天后回到指挥位置，他希望德
在冲出房间之前，希特勒还让陆军总司令提交一份详细报告，其中要详细列出违反军纪的部队番号、违反了什么样的军纪，以及陆军对他们的处理结果。然后他狠狠地甩上了房门，留下脸色苍白的布劳希奇独自瑟瑟发抖。
11月5日的那次会面后，希特勒连续几个星期都没有和布劳希奇说过一句话。在11月23日那天，希特勒开始流露出撤换布劳希奇的想法，但他找不到可以替代布劳希奇的合适人选。
1940年1月，希特勒的副官施蒙特从前线赶回来，他带回来了曼施坦因的方案。希特勒发现曼施坦因的想法和自己在去年10月提出的将进攻方向南移很相似，这让他确信了自己与生俱来的指挥天赋，同时还证实了他的方案具备可行性。当他得知布劳希奇和哈尔德早就知道这个计划，但是拒绝向希特勒汇报时，又进一步增加了对布劳希奇的厌恶。
1940年5月10日，法国战役开始。十天后德军抵达了大西洋沿岸。6月21日，法国战败投降。欣喜若狂的希勒特决定犒赏那些有功将领，晋升他们为元帅。他本来计划不晋升布劳希奇，可让一位大将领导众多元帅也实在不通常理，加上胜利太辉煌，心情愉快的希特勒才逐渐减少了对布劳希奇的厌恶。7月19日，他与11个将领一道晋升为元帅。
也许是心怀愧疚，或者意识到自己在希特勒的心中的地位正快速下降。在准备入侵英国的海狮计划时，布劳希奇签署了一项骇人听闻的命令。他要求在占领英国后，把所有17岁至45岁的英国男子掳掠到欧洲大陆，把他们全部变成为德国的奴隶劳工。当时英国人口是5300多万，如果这项命令付诸实施，那将是人类历史上空前绝后的浩劫。